Cargar paquetes en R

Cargar paquetes en R
“Crear paquetes es una buena manera de hacer que su trabajo/código/programa se organice y compartirlo con otros para que puedan reutilizarlo. Código, conjuntos de datos, documentación de aquellas funciones que se utilizan dentro del paquete, y algunas pruebas están contenidas por un paquete. Podemos descargar e instalar los paquetes desde repositorios. Un repositorio es una ubicación o plataforma para almacenar paquetes para que cualquiera pueda usarlos después de la instalación. Las organizaciones y los desarrolladores tienen su repositorio local, que generalmente está en línea y abierto al público. CRAN, Bioconductor y Github son algunos de los repositorios de paquetes R más destacados."

¿Cuáles son los paquetes en el lenguaje de programación R en Ubuntu 20?.04?

Es una colección de muestras de datos, funciones R y scripts de compilación. Estos paquetes se encuentran en el directorio en el entorno R, que se conoce como la biblioteca. R es instalado por R durante el proceso de instalación. Los paquetes se pueden agregar más adelante si son necesarios para una funcionalidad o propósito específico. Cuando iniciamos la consola R, los paquetes predeterminados estarán disponibles solo para usar. Para usar paquetes que ya se han instalado en nuestro sistema, tenemos que cargarlos explícitamente.

Cómo cargar y usar paquetes en el lenguaje de programación R en Ubuntu 20.04?

Primero debe instalar y luego cargar un paquete en su biblioteca R antes de poder usarlo. La biblioteca es un directorio en el que se cargan los paquetes de la sesión R actual. Los paquetes deben cargarse en la biblioteca para cada sesión.

Los siguientes son algunos ejemplos en los que veremos cómo instalar los paquetes en R para que puedan cargarse para su uso en el lenguaje de programación R

Ejemplo 1: Instalación de paquetes R

Hay diferentes formas de instalar los paquetes en R. Discutiremos solo algunos de ellos en este ejemplo.

Instalación desde CRAN

CRAN es un acrónimo de la red de archivos R integral. Es el repositorio oficial de la comunidad R, que se actualiza regularmente. Para ser aceptado en CRAN, un paquete debe aprobar una serie de pruebas para asegurarse de que cumpla con las reglas y políticas de CRAN. Para instalar un paquete de CRAN, debe conocer el nombre de ese paquete, para que podamos usarlo en el siguiente comando.

El compilador iniciará el proceso de instalación presionando ENTER después del comando anterior. Se pueden instalar múltiples paquetes a la vez. Para esto, escribiremos los nombres de los paquetes como un vector de caracteres.

Instalación desde bioconductor

La forma estándar de instalar un paquete desde bioconductor es pasar la siguiente URL dentro de la función de origen.

Esto instalará la función que se requiere para instalar paquetes de bioconductores. Después de instalar la función requerida, puede escribir el nombre de los paquetes de bioconductores o el vector de caracteres de sus nombres dentro de la función VioClite ().

Instalación desde Github

El paquete R DevTools se puede utilizar para instalar un paquete desde GitHub. Ayudará a los usuarios al proporcionar las funciones necesarias para simplificar las tareas comunes en R.

La instrucción posterior se puede utilizar para instalar paquetes GitHub. Puede dar una ruta en lugar de "paquete_path" para instalar el paquete requerido.

Ejemplo 2: Carga de paquetes R

Una vez que haya terminado con la instalación de paquetes en el entorno R, para que los paquetes sean útiles, debemos cargarlos en R para la sesión actual.

El comando biblioteca () se puede usar para cargar el paquete de idioma R, como se ve a continuación:

Puede escribir el nombre del paquete requerido dentro de la función de la biblioteca si necesitamos cargar un paquete que estaba instalado previamente pero que no esté disponible en el entorno que estamos utilizando. El siguiente comando se usa para cargar un paquete.

Aquí lib () es una función que se utiliza para dar la ruta de la biblioteca en la que se encuentran/almacenan los paquetes R instalados. Para cargar un archivo en la sesión actual, utilizaremos la instrucción a continuación.

En la instalación.paquetes () Especificaremos la ruta de nuestro paquete donde se encuentra nuestro paquete. Si solo necesitamos acceder a algunas funciones o datos dentro de un paquete de manera ocasional, podemos usar el siguiente comando.

En el ejemplo anterior, usaremos el nombre del paquete del que queremos usar una función específica, y escribiremos el nombre de la función en el lugar de "function_name ()."

R también le permite descargar un paquete de la sesión actual usando el comando DETACH ().

Ejemplo 3: Administración de paquetes R

En R, puede usar algunos comandos para ayudarlo a administrar los paquetes que usa e instalar. También podemos ver qué paquetes están disponibles, así como qué paquetes están instalados y cargados en nuestro entorno. Podemos verificar las actualizaciones disponibles y asegurarnos de que estén actualizados. El comando posterior demuestra una lista de los paquetes R cargados en la sesión actual usando Search ().

Para verificar qué paquetes están instalados en nuestro sistema, utilizaremos.comando de paquetes ().

Proporcionará una matriz con una fila para cada paquete y columnas para obtener información sobre los paquetes, como la ruta de la biblioteca, versiones, dependencias, detalles de la licencia, etc.

Los paquetes instalados se pueden actualizar utilizando la actualización.comando de paquetes ().

Si no escribimos el nombre del paquete en el comando, verificará todos los paquetes de nuestro sistema para actualizarlos.

También podemos eliminar un paquete de nuestro sistema utilizando eliminar.comando de paquetes ().

Escribirá el nombre del paquete en el comando anterior para eliminarlo de su sistema.

Conclusión

En este artículo, tratamos de enseñarle el concepto básico de los paquetes R y cómo puede usarlos en el lenguaje de programación R en Ubuntu 20.04. Ahora, debe ser capaz de instalar paquetes y cargarlos en su sistema. Implementamos algunos ejemplos en este tutorial para explicarle cómo instalar paquetes de diferentes tipos de repositorios, cómo puede cargarlos en la sesión actual, cómo separarlos, cómo verificar los paquetes instalados en su sistema, cómo actualizar ellos y cómo eliminar los paquetes de su sistema que ya no se requieren.